中心于2014年成立，初始为实训中心，主要承担规培技能培训考核工作，并由内外科基地分管。2020年8月实训中心正式更名医学模拟教学中心，隶属于教学办。2023年12月挂牌成为国家级实验教学示范中心上海交通大学临床技能实验教学示范中心、上海交通大学医学院临床技能实验教学示范中心儿科学院分中心。目前中心总面积达到1080平方米。由临床基础技能、急救技能、情景模拟、内科基本技能、外科基本技能、虚拟微创技术、虚拟内镜、医学人文八大模块组成。已开设了41门教学课程，涵盖临床所有专业，有腹腔镜模拟箱（干、湿）、腹腔镜虚拟训练教学系统，可开展进阶式腹腔镜技能和专项术式培训；有虚拟教学系统和设备，模拟术式操作；有高端智能综合模拟人，可开展情景模拟教学；有先进的智能化多功能教室，可以开展思维训练、OSCE考核，中心是美国心脏协会心血管急救培训点，可开展基础生命支持及儿科高级生命支持学员课程和导师课程培训。模拟教学中心基于医疗需求，致力于多维度建设，与多家单位协作，积极开展线上+线下混合式教学模式，重点打造腹腔镜进阶训练课程和情景模拟教学。通过创建覆盖临床医学教育全过程的系统化、规范化的临床技能教学环境，提高临床人员和医学生的综合素质，推进医院内涵建设。